Ученые Института цитологии (ИНЦ) РАН разработали модель, которая позволяет повысить точность предсказаний взаимодействия потенциальных лекарственных соединений с мембранами клеток пациента. Эксперименты проводились на флавоноидах — природных пигментах, которые придают цвет овощам и фруктам и в то же время являются антиоксидантами.
В качестве исследуемого вещества ученые ИНЦ РАН использовали три соединения класса флавоноидов — байкалеин, хризин и лютеолин. Их выбрали в качестве модельных, поскольку уже много лет ученые изучают полезные свойства именно этих соединений.
«Моделирование помогает понять, как молекулы меняют жесткость или электростатику мембран, что может лежать в основе их антиоксидантного или противоопухолевого действия. Выбранный подход позволяет повысить точность компьютерного моделирования, а также отсеивать неэффективные или токсичные соединения на ранних этапах исследования, сокращая количество дорогостоящих лабораторных тестов», — сказала научный сотрудник Лаборатории моделирования мембран и ионных каналов ИНЦ РАН Анна Малыхина.
Специалист уточнила, что ученые сравнили результаты моделирования с реальными экспериментами в лаборатории: при помощи метода дифференциальной сканирующей микрокалориметрии измерили влияние флавоноидов на фазовые переходы липидов клеточной мембраны и их упаковку. «Сравнение результатов моделирования при помощи нашего фреймворка и лабораторных экспериментов с реальными соединениями показало высокую степень достоверности компьютерной симуляции», — добавила она.